Chương trình Vi sinh vật học

Các nhóm vi khuẩn chủ yếu 1
Các nhóm vi khuẩn chủ yếu 2
Các nhóm vi khuẩn chủ yếu 3
Các nhóm vi khuẩn chủ yếu 4
Các nhóm vi khuẩn chủ yếu 5
Các nhóm vi khuẩn chủ yếu 6
Các nhóm vi khuẩn chủ yếu 7



======== * ========

Theo quan điểm hiện đại (NCBI- National Center for Biotechnology Information, 2005) thì vi khuẩn bao gồm các ngành sau đây :

1.          -Aquificae

2.          -Thermotogae

3.          -Thermodesulfobacteria

4.          -Deinococcus-Thermus 

5.          -Chrysiogenetes

6.          -Chloroflexi

7.          -Nitrospirae

8.          -Defferribacteres

9.          -Cyanobacteria

10.          -Proteobacteria

11.          -Firmicutes

12.          -Actinobacteria

13.          -Planctomycetes

14.          -Chlamydiae/Nhóm Verrucomicrobia

15.          -Spirochaetes

16.          -Fibrobacteres /Nhóm Acidobacteria

17.          -Bacteroidetes/Nhóm Chlorobia

18.          -Fusobacteria

19.          -Dictyoglomi

Việc phân ngành dựa trên các đặc điểm hình thái, sinh lý, sinh hóa, sinh thái...

Căn cứ vào tỷ lệ G + C trong ADN người ta xây dựng được cây phát sinh chủng loại (Phylogenetic tree) và chia vi khuẩn thành 11 nhóm sau đây :

1.          -Nhóm Oxy hoá Hydrogen

2.          -Nhóm Chịu nhiệt

3.          -Nhóm Vi khuẩn không lưu huỳnh màu lục

4.          -Nhóm Deinococcus

5.          -Nhóm Vi khuẩn lam

6.          -Nhóm Proteobacteria

7.          -Nhóm Chlamydia

8.          -Nhóm  Planctomyces

9.          -Nhóm Spirochaetes (Xoắn thể)

10.          -Nhóm Vi khuẩn lưu huỳnh màu lục

11.          -Nhóm Cytophaga

12.          --Nhóm Vi khuẩn Gram dương

Sơ đồ về các loài điển hình

Để có khái niệm về các chi vi khuẩn thường gặp chúng ta làm quen với một số khoá phân loại đơn giản, dựa trên các đặc điểm về hình thái, sinh lý , sinh hoá. Trong thực tiễn với các loài vi khuẩn gây bệnh người ta thường chẩn đoán thêm bằng phản ứng huyết thanh (với các kháng thể đặc hiệu)

1.Vi khuẩn quang hợp (Phototrophic bacteria) :

1.1.Vi khuẩn lưu huỳnh màu tía (Purple sulfur bacteria):

Thuộc nhóm này là các vi khuẩn kỵ khí bắt buộc, có khả năng quang tự dưỡng vô cơ (photolithoautotroph), tế bào có chứa chlorophyll a hoặc b , hệ thống quang hợp chứa các màng hình cầu hay hình phiến (lamellar) gắn với màng sinh chất. Để dùng làm nguồn cho điện tử (electron donors) trong quang hợp thường sử dụng H_2, H₂S hay S .  Có khả năng di động với tiên mao mọc ở cực, có loài chu mao, tỷ lệ G+C là 45-70%.

a- Họ Chromatiaceae:

                   1.1.1- Chi Thiospirium

         1.1.2. Chi Chromatium

         1.1.3. Chi Thiocapsa

         1.1.4. Chi Thiocystis

         1.1.5. Chi Thiospirillum

         1.1.6. Chi Thiorhodovibrio

         1.1.7. Chi Amoebobacter

         1.1.8. Chi Lamprobacter

         1.1.9. Chi Lamprocystis

         1.1.10.Chi Thiodyction

         1.1.11.Chi Thiopedia

         1.1.12. Chi Rhabdochromatium

         1.1.13. Chi Thiorhodococcus

Chromatium	Thiocapsa

Thiocystis	Thiospirillum

Lamprocystis	Thiopedia

b- Họ Ectothiorhodospiraceae:

         1.1.14- Chi Ectothiorhodospirace

         1.1.15- Chi Halorhodospira

1.2-Vi khuẩn không lưu huỳnh màu tía (Nonsulfure purple bacteria)

         Vi khuẩn không lưu huỳnh màu tía là nhóm vi khuẩn quang dị dưỡng hữu cơ (photoorganoheterotrophs) thường kỵ khí bắt buộc, một số loài là quang tự dưỡng vô cơ không bắt buộc (trong tối là hoá dị dưỡng hữu cơ-  chemoorganoheterotrophs). Tế bào chứa chlorophyl a hoặc b, hệ thống quang hợp chứa các màng hình cầu hay hình phiến (lamellar) gắn với màng sinh chất. Để dùng làm nguồn cho điện tử (electron donors) trong quang hợp thường sử dụng chất hữu cơ, đôi khi sử dụng hợp chất lưu huỳnh dạng khử hoặc H₂. Có khả năng di động với tiên mao mọc ở cực, hoặc không di động, một số loài có túi khí (gas vesicles), tỷ lệ G+C là 61-72%. 

         1.2.1- Chi Blastochloris

         1.2.2- Chi Phaeospirillum

         1.2.3- Chi Rhodobacter

         1.2.4- Chi Rhodobium

         1.2.5- Chi Rhodocista

         1.2.6- Chi Rhodocyclus

         1.2.7- Chi Rhooferax

         1.2.8- Chi Rhodomicrobium

         1.2.9- Chi Rhodoplanes

         1.2.10-Chi Rhodopila

         1.2.11- Chi Rhodopseudomonas

         1.2.12- Chi Rhodospira

         1.2.13- Chi Rhodospirillum

         1.2.14- Chi Rhodothalassium

         1.2.15- Chi Rhodovibrio

         1.2.16-Chi Rhodovulum

         1.2.17- Chi Rosespira

         1.2.18- Chi Rubiviva

Rhodospirillum	Rhodospirillum dưới KHV điệntử

Rhodopseudomonas	Rhodopseudomonas dưới KHV điện tử

Rhodobacter	Rhodopila

Rhodocyclus purpureus	Rhomicrobium

1.3.Vi khuẩn lưu huỳnh màu lục (Green sulfure bacteria)

Thuộc nhóm này là các vi khuẩn kỵ khí bắt buộc, có khả năng quang tự dưỡng vô cơ (photolithoautotroph), tế bào có chứa chlorophyll a cùng với b , c hoặc e, chứa caroten nhóm 5, hệ thống quang hợp  liên quan đến các lục thể (chlorosom) và độc lập đối với màng sinh chất. Để dùng làm nguồn cho điện tử (electron donors) trong quang hợp thường sử dụng H_2, H₂S hay S .  Hạt lưu huỳnh tích luỹ bên ngoài tế bào Không có khả năng di động  , một số loài có túi khí;  tỷ lệ G+C là 48-58%.

1.3.1- Chi Chlorobium

1.3.2- Chi Prosthecochloris

1.3.3- Chi Pelodictyon

1.3.4- Chi Ancalichliris

1.3.5- Chi Chloroherpeton

Chlorobium	Pelodictyon

Prosthecochloris

1.4.Vi khuẩn không lưu huỳnh màu lục (Green nonsulfur bacteria)

Thuộc nhóm này là các vi khuẩn đa bào, dạng sợi,thường kỵ khí không bắt buộc ,thường là quang dị dưỡng (photoheterotroph), có loài quang tự dưỡng hoặc hoá dị dưỡng. Tế bào có chứa chlorophyll a và c, trong điều kiện kỵ khí thấy có chlorosom. Để dùng làm nguồn cho điện tử (electron donors) trong quang dị dưỡng là glucose, axit amin, axit hữu cơ; trong quang tự dưỡng là H_2, H₂S. Di động bằng phương thức  trườn (gliding) ,   tỷ lệ G+C là  53-55%. Chi điển hình là Chloroflexus., Chloronema

Chloronema	Chloroflexus

(còn tiếp)